Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf2P58021 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf2P58021 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms