Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtnsP57757 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtnsP57757 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms