Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NcstnP57716 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NcstnP57716 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms