Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TdgP56581 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TdgP56581 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TdgP56581 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TdgP56581 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TdgP56581 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TdgP56581 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TdgP56581 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms