Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckbrP56481 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckbrP56481 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms