Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn2bP55271 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms