Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sh3bp1P55194 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sh3bp1P55194 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sh3bp1P55194 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp1P55194 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp1P55194 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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