Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtskP55097 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtskP55097 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CtskP55097 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtskP55097 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtskP55097 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtskP55097 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtskP55097 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtskP55097 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms