Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms