Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CnbpP53996 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CnbpP53996 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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