Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cux1P53564 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cux1P53564 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cux1P53564 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms