Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DbtP53395 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DbtP53395 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DbtP53395 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DbtP53395 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms