Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Dbx1P52950 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dbx1P52950 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dbx1P52950 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms