Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1cP52432 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms