Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClgnP52194 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms