Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApodP51910 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApodP51910 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ApodP51910 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ApodP51910 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ApodP51910 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms