Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LumP51885 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LumP51885 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LumP51885 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LumP51885 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms