Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RoraP51448 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RoraP51448 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RoraP51448 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RoraP51448 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RoraP51448 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RoraP51448 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RoraP51448 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RoraP51448 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RoraP51448 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms