Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pa2g4P50580 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pa2g4P50580 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms