Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Epb42P49222 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Epb42P49222 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms