Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CitP49025 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CitP49025 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CitP49025 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms