Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnni3P48787 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms