Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms