Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Resp18P47939 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Resp18P47939 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms