Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl6P47911 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl6P47911 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms