Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emp1P47801 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Emp1P47801 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Emp1P47801 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms