Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx2-2P42586 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms