Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3caP42337 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms