Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Elk3P41971 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Elk3P41971 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Elk3P41971 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms