Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ThpoP40226 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms