Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd1P40201 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms