Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf2P39429 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms