Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh4P39038 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms