Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Folr1P35846 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Folr1P35846 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms