Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab20P35295 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms