Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn11P35235 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn11P35235 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms