Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms