Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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