Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms