Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VtnP29788 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VtnP29788 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VtnP29788 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VtnP29788 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms