Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mmp3P28862 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms