Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprmP28828 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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