Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RxraP28700 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxraP28700 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RxraP28700 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RxraP28700 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RxraP28700 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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