Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms