Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apex1P28352 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms