Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja4P28235 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms