Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vav1P27870 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms