Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenpbP27790 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpbP27790 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpbP27790 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms