Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2afxP27661 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2afxP27661 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms