Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra3P26049 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra3P26049 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms